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PhiC31

        PhiC31PhiC31λPhiC31attPattBЧPhiC31attBеattPеPhiC31·λ

       attPλPhiC31M{vas-int.Dm}ZH-2AP{nos-phiC31\int.NLS}X

       vermilion+Σ磬attP-gRNAбv+attPG0y-v-v+v+ G2v- attPPlan HPlan Ivermilion+gRNACas9 F1Plan RG/RH/RI


P{CaryP}
     
CalosP-elementP{CaryP}attP (yellow)

        PerrimonкP{CaryP}еλλЧ (Position Effect)

        BellenYP{CaryP}attPе


PhiC31-RMCE

        WuP{attP.w+.attP}BatemanP{attP.w+.attP}{attB..attB}λ{attL..attL}

       attBеPhiC31-RMCEλκattPд

       οWu

       http://genepath.med.harvard.edu/WuLab/RMCE 


P[acman]

        BellenP[acman]attPλyellowBAC (oriSBACoriV) Gap-repair

        BellenP[acman]С21 kb83 kbBACCHORI BACPACС

        οBellenP[acman] ResoucesCHORI BACPAC Resources 
      
http://flypush.imgen.bcm.tmc.edu/lab/index.html

         http://bicoid.lbl.gov/cgi-bin/gbrowse/getbac/

         https://bacpac.chori.org/library.php?id=444

         BACPhiC31

FlyC31
      
BaslerкM{3xP3-RFPattP}λM{vas-int.Dm}ZH-2APhiC31PhiC31PhiC31BDSCFlyC31attPλM{vas-int.Dm}ZH-2A

        FlyC31attPloxPУCre/loxP鷴г (3xP3-RFPw+DNAе)loxP--attLС

        FluorescenceFlyC31attPλCre/loxPгλ3xP3-RFPУλNF (RFP) M{vas-int.Dm}NFZH-2AloxPеCre/loxPгУloxP--attLС

         οFlyC31б

       http://www.frontiers-in-genetics.org/flyc31/

MiMIC
     
MiMICBellenHoskinsSpradlingMinosλ鲼5371attPк30attBк壬βλattBеλκattPд

         οBellenMiMIC 
      
http://flypush.imgen.bcm.tmc.edu/pscreen/technique.html 

PhiC31Gateway

         PhiC31attBλGatewayGateway-PhiC31FlyC31Gateway attB 

         GatewayMurphy The Drosophila Gateway?  Vector collection attP1attP2attB1attB2PhiC31attPattB


ο:

Groth A, Fish M, Nusse R, Calos MP (2004) Construction of transgenic Drosophila by using the site-specific integrase from phage PhiC31. Genetics 166: 1775

Markstein M, Pitsouli C, Villalta C, Celniker SE, Perrimon N (2008) Exploiting position effects and the gypsy retrovirus insulator to engineer precisely expressed transgenes. Nature Genetics 40: 476

Szabad J, Bellen HJ, Venken KJT (2012) An Assay to Detect In Vivo Y Chromosome Loss in Drosophila Wing Disc Cells. G3 (Bethesda) 2(9): 1095

Bateman JR, Lee AM, Wu C-t (2006) Site-specific transformation of Drosophila via PhiC31 integrase-mediated cassette exchange. Genetics 173: 769

Sun FF, Johnson JE, Zeidler MP, Bateman JR (2012) Simplified Insertion of Transgenes Onto Balancer Chromosomes via Recombinase-Mediated Cassette Exchange. G3 2: 551

Venken KJT, He Y, Hoskins RA, Bellen HJ (2006) PhiC31: a BAC transgenic platform for targeted insertion of large DNA fragments in Drosophila melanogaster. Science 314: 1747

Bischof J, Maeda RK, Hediger M, Karch F, Basler K (2007) An optimized transgenesis system for Drosophila using germ-line-specific PhiC31 integrases. Proc Natl Acad Sci USA 104: 3312

Venken KJT, Schulze KL, Haelterman NA, Pan H, He Y, Evans-Holm M, Carlson JW, Levis RW, Spradling AC, Hoskins RA, Bellen HJ (2011) MiMIC: a highly versatile transposon insertion resource for engineering Drosophila melanogaster genes. Nat Methods 8(9): 737


P{CaryP}

λ BDSC# Cytosite# 1 Ч[(BACs)]2
attP18 32107 y1 w67c23 P{CaryP}attP18 6C12 3.4 (0.0)
attP4 -
y1 w67c23 P{CaryP}attP4 12C6 2.1 (0.0)
attP3 32230 y1 w* P{CaryP}attP3 19C4 0.7 (0.7)
attP40 - y1 w67c23; P{CaryP}attP40 25C6 7.1 (4.2)
attP30 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP30 29C3 - (nd)
attP14 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP14 36A10 1.7 (1.0)
attP33 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP33 50B6 4.8 (1.3)
attP16 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP16 53C4 4.5 (1.6)
attP1 8621 y1 w67c23; P{CaryP}attP1 55C4 4.5 (2.2)
attP23 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP23 60C7 - (nd)
attP88 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP88 64A12 - (nd)
attP2 8622 y1 w67c23; P{CaryP}attP2 68A4 5.4 (2.0)
attP112 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP112 68C13 4.0 (nd)
attP10 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP10 85D8 0.7 (nd)
attP64 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP64 89B9 4.5 (nd)
attP52 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP52 89B11 ?
- (nd)
attP154 -
y1 w67c23; P{CaryP}attP154 97D2 5.0 (1.8)
attPY 41124 y1 w*/Dp(2;Y)G; P{CaryP}attPY Y 5.9 (nd)
# FlyBase Drosophila melanogaster (R6.10)

1

2 Ч ж>30 kb BAC

PhiC31-RMCE

λ
ο BDSC#
Cytosite#

3
Ч[ (BACs)]2
JB37B
27387
P{attP.w+.attP}JB37B
37B7
6.8 (nd)
JB38F
27388
P{attP.w+.attP}JB38F
38F1
5.8 (nd)
JB53F
27386
P{attP.w+.attP}JB53F
53F8
2.6 (nd)
JB89B
25091
P{attP.w[+].attP}tara[JB89B]
89B8
6.3 (nd)
38451
38451
w1118; Dr1/TM3, P{attP.w+.attP}FS10 Sb1 Ser1
79A2
2.0 (nd)
38452
38452
w1118; Dr1/TM3, Sb1 Ser1 P{attP.w+.attP}FS18
100D1
2.0 (nd)
38453
38453
y1 w*; snaSco/CyO, P{attP.w+.attP}J04
37B8
8.0 (nd)
38454
38454
y1 w*; snaSco/CyO, P{attP.w+.attP}J08
37F2
4.0 (nd)
38455
38455
FM7h, P{attP.w+.attP}FS2/C(1)DX, y1 f1
10B6
2.3 (nd)
38456
38456
FM7h, P{attP.w+.attP}FS5/C(1)DX, y1 f1
6F3
3.0

# FlyBase Drosophila melanogaster (R6.10)

2 Ч ж>30 kb BAC

3 P{attP.w+.attP}

P[acman]

λ
BDSC#
Cytosite#

1
Ч[ (BACs)]2
VK10
97294
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00010
chromosome 2
-
- (nd)
VK15
9734
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00015
chromosome 2
3.0 (2.4)
VK38
9753
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00038
5B8
2.9 (1.1)
VK06
9726
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00006
19E7
1.8 (1.3)
VK37
9752
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00037
22A3
4.7 (2.4)
VK12
9731
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00012
25A3
0.0 (nd)
VK02
9723
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00002
28E7
5.9 (2.9)
VK03
9724
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00003ab
31B1, 40A4
5.0 (3.2)
VK03a
9724a
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00003a
31B1
- (nd)
VK03b
9724b
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00003b
40A4
8.2 (8.2)
VK11
9730
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00011
40E4
0.3 (0.0)
VK14
9733
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00014
43A1
5.5 (3.6)
VK16
9735
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00016
47C6
2.2 (0.0)
VK08
9728
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00008
50A3
9.0 (nd)
VK30
9747
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00030
50E1
3.3 (1.4)
VK18
9736
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00018
53B2
6.0 (2.7)
VK22
9740
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00022
57F5
4.2 (3.2)
VK01
9722
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00001
59D3
4.3 (4.3)
VK31
9748
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00031
62E1
5.9 (2.7)
VK33
9750
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00033
65B2
5.1 (3.8)
VK39
9754
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00039
67E4
-
4.8 (nd)
VK19
9737
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00019
68D2
4.2 (1.9)
VK23
9741
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00023
70A2
4.4 (3.8)
VK36
9751
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00036
70C4
- (nd)
VK05
9725
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00005
75A10
6.2 (2.4)
VK13
9732
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00013
76A2
5.3 (4.4)
VK21
9739
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00021
76C5
- (nd)
VK29
97464
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00029
80
-
- (nd)
VK07
9727
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00007
82A1
2.1 (0.0)
VK32
9749
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00032
85A2
2.0 (0.0)
VK40
9755
PBac{yellow[+]-attP-3B}VK00040
87B10
2.4 (1.2)
VK27
9744
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00027
89E11
6.8 (1.8)
VK28
9745
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00028
92F1
4.3 (2.0)
VK26
9743
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00026
96F3
3.1 (3.8)
VK20
9738
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00020
99F8
5.3 (4.9)
VK24
97424
PBac{yellow[+]-attP-9A}VK00024
101F1
0.0 (nd)

# FlyBase Drosophila melanogaster (R6.10)

1

2 Ч ж>30 kb BAC

4 Щ

FlyC31

λ
ο BDSC#
CytoSite#

1
Ч [ (BACs)]2
ZH-2A
24480
M{3xP3-RFP.attP'}ZH-2A
2A3
2.8 (0.6)
ZH-22A
24481
M{3xP3-RFP.attP'}ZH-22A
22A2
5.1 (3.4)
ZH-51C
24482
M{3xP3-RFP.attP'}ZH-51C
51C1
7.2 (5.1)
ZH-51D
244835
M{3xP3-RFP.attP}ZH-51D
51D9
6.0 (2.4)
ZH-58A
24484
M{3xP3-RFP.attP}ZH-58A
58A3
7.2 (5.5)
ZH-68E
24485
M{3xP3-RFP.attP'}ZH-68E
68E1
6.8 (3.5)
ZH-86Fa
24486
M{3xP3-RFP.attP'}ZH-86Fa
86E18
7.0 (3.8)
ZH-86Fb
24749
M{3xP3-RFP.attP}ZH-86Fb
86F8
7.1 (4.0)
ZH-96E
244876,7
M{3xP3-RFP.attP'}ZH-96E (with M{vas-int.Dm}ZH-2A)
96E10
2.5 (nd)
ZH-102D
24488
M{3xP3-RFP.attP}ZH-102D (with M{vas-int.Dm}ZH-2A)
102F4
7.1 (4.0)
24480NF
-
24480NF8 ZH-2A
2A3
2.0 (nd)
24481NF
-
24481NF8 ZH-22A
22A2
0.0 (nd)
24482NF
-
24482NF8 ZH-51C
51C1
0.5 (nd)
24483NF
-
24483NF8 ZH-51D
51D9
5.4 (nd)
24484NF
-
24484NF8 ZH-58A
58A3
1.7 (nd)
24485NF
-
24485NF8 ZH-68E
68E1
0.0 (nd)
24486NF
-
24486NF8 ZH-86Fa
86E18
4.0 (nd)
24749NF
-
24749NF8 ZH-86Fb
86F8
7.7 (nd)

# FlyBase Drosophila melanogaster (R6.10)

1

2 ЧЧ ж>30 kb BAC

5 λhibrisEnhancer trapоλ ectopic expression

6

7 Service WPCRλ

8 M{vas-int.Dm}ZH-2AloxP-3xP3-RFPλM{loxP. attP}M{loxP. attP}

λ
BDSC#
CytoSite#

1
Ч[(BACs)]2
su(Hw)attP8
32233
y1 w* P{CaryIP}su(Hw)attP8
8E10
3.2 (0.0)
su(Hw)attP6
347679
y1 w* P{CaryIP}su(Hw)attP6
24A2
3.0 (nd)
su(Hw)attP5
34765
y1 w* P{CaryIP}su(Hw)attP5
50F1
3.2 (nd)
su(Hw)attP4
34763
y1 w* P{CaryIP}su(Hw)attP4
67E2
2.0 (nd)
su(Hw)attP1
347607
y1 w* P{CaryIP}su(Hw)attP1
87B13
5.6 (nd)
su(Hw)attP2
347619
y1 w* P{CaryIP}su(Hw)attP2
92D9
3.5 (nd)
-
3476910
y1 P{CaryIP}su(Hw)attP8 v1
8E10
-
6.0 (nd)
VIE260B
VDRC#60100
P{attP,y+,w3'}VIE-260B
2L
8.7 (nd)
JK22C aka JMK-96
-
w1118; P{CaryP}JK22C
22C3
2.6 (0.0)
JK73A aka JMK-97
-
w1118; P{CaryP}JK73A
65C3
4.4 (0.0)
JK65C aka JMK-98
-
w1118; P{CaryP}JK65C
66B4
4.6 (0.0)
JK66B aka JMK-99
-
w1118; P{CaryP}JK66B
73A9
5.9 (1.2)

# FlyBase Drosophila melanogaster (R6.10)

1

2 Че ж>30 kb BAC

7 Service WPCRλ

9 Service WPCRλ

10 vermilion+attPλX

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